Да. В последних "development builds" (здесь, на форуме) есть настройка в разделе уведомления, "уведомлять о".
Поменяйте "всех непрочтенных" на "новых непрочтенных".
После этого, если будете "смахивать" уведомление, то повторного, о том же сообщении, не будет.